Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RykQ01887 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RykQ01887 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms