Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms