Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms