Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms