Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2bQ01097 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2bQ01097 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms