Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds1P98191 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms