Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VldlrP98156 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms