Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms