Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms