Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas2P97460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms