Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nbr1P97432 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms