Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms