Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms