Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1bP97358 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms