Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RptnP97347 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RptnP97347 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RptnP97347 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RptnP97347 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RptnP97347 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms