Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms