Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx2P80206 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otx2P80206 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms