Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms