Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms