Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad1P70340 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad1P70340 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms