Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux2P70298 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms