Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms