Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms