Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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