Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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