Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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