Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d2P62838 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms