Protein–RNA interactions for Protein: P62137

Ppp1ca, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1caP62137 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1caP62137 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1caP62137 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms