Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp46P62069 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms