Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufm1P61961 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms