Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vbp1P61759 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vbp1P61759 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Vbp1P61759 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Vbp1P61759 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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