Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms