Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8bP61028 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab8bP61028 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms