Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rin3P59729 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rin3P59729 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms