Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms