Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms