Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps33bP59016 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps33bP59016 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms