Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms