Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms