Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtnsP57757 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtnsP57757 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms