Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms