Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp25P57080 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp25P57080 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp25P57080 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp25P57080 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp25P57080 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms