Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms