Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TdgP56581 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TdgP56581 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TdgP56581 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TdgP56581 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TdgP56581 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms