Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckbrP56481 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckbrP56481 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckbrP56481 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms