Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CdaP56389 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms