Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pex2P55098 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pex2P55098 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms