Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtskP55097 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtskP55097 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms