Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GemP55041 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GemP55041 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GemP55041 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GemP55041 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms