Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms